Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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BEST4Q8NFU0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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