Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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SPC24Q8NBT2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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SPC24Q8NBT2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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SPC24Q8NBT2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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SPC24Q8NBT2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPC24Q8NBT2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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