Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTL3Q8N8U3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms