Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC27.54■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC27.53■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC27.52■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC27.52■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC27.52■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
P3H3Q8IVL6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
P3H3Q8IVL6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms