Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11FIP4Q86YS3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11FIP4Q86YS3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11FIP4Q86YS3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11FIP4Q86YS3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11FIP4Q86YS3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11FIP4Q86YS3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11FIP4Q86YS3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11FIP4Q86YS3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11FIP4Q86YS3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11FIP4Q86YS3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11FIP4Q86YS3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11FIP4Q86YS3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11FIP4Q86YS3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11FIP4Q86YS3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11FIP4Q86YS3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11FIP4Q86YS3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11FIP4Q86YS3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11FIP4Q86YS3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11FIP4Q86YS3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11FIP4Q86YS3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11FIP4Q86YS3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11FIP4Q86YS3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11FIP4Q86YS3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11FIP4Q86YS3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11FIP4Q86YS3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms