Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms