Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms