Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HACD2Q6Y1H2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms