Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms