Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms