Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms