Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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