Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms