Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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SSX1Q16384 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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