Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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