Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms