Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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