Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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LAPTM4AQ15012 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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