Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL19A1Q14993 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms