Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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