Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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