Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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KLF9Q13886 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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