Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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CUL4AQ13619 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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CUL4AQ13619 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
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