Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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