Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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