Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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