Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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