Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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