Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
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