Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.251e-9■■■□□ 15
PABPC4Q13310 CMC2-203ENST00000561614 683 ntTSL 35.91□□□□□ -1.461e-9■■■□□ 15
PABPC4Q13310 CMC2-216ENST00000566231 652 ntTSL 34.78□□□□□ -1.641e-9■■■□□ 15
PABPC4Q13310 CMC2-215ENST00000566047 660 ntTSL 24.78□□□□□ -1.641e-9■■■□□ 15
PABPC4Q13310 SH3GLB2-211ENST00000479237 2794 ntTSL 1 (best)17.84■□□□□ 0.451e-6■■■□□ 15
PABPC4Q13310 SH3GLB2-209ENST00000461811 4828 ntTSL 1 (best)14.34□□□□□ -0.111e-6■■■□□ 15
PABPC4Q13310 BTF3-202ENST00000380591 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 03e-54■■■□□ 15
PABPC4Q13310 BTF3-201ENST00000335895 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.743e-54■■■□□ 15
PABPC4Q13310 BTF3-209ENST00000514505 740 ntTSL 57.02□□□□□ -1.293e-54■■■□□ 15
PABPC4Q13310 BTF3-208ENST00000514360 1177 ntTSL 26.98□□□□□ -1.293e-54■■■□□ 15
PABPC4Q13310 BTF3-205ENST00000509708 515 ntTSL 56.01□□□□□ -1.453e-54■■■□□ 15
PABPC4Q13310 USF2-204ENST00000593708 474 ntTSL 326.4■■□□□ 1.821e-6■■■□□ 15
PABPC4Q13310 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.377e-7■■■□□ 15
PABPC4Q13310 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.027e-7■■■□□ 15
PABPC4Q13310 TMBIM1-219ENST00000465082 2874 ntTSL 214.2□□□□□ -0.147e-7■■■□□ 15
PABPC4Q13310 TMBIM1-214ENST00000444881 2936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.447e-7■■■□□ 15
PABPC4Q13310 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.481e-8■■■□□ 15
PABPC4Q13310 SLC7A5-203ENST00000565644 3983 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.41e-8■■■□□ 15
PABPC4Q13310 LRWD1-204ENST00000468175 847 ntTSL 324.5■■□□□ 1.514e-6■■■□□ 15
PABPC4Q13310 KIFC3-221ENST00000565397 810 ntTSL 323.1■■□□□ 1.297e-8■■■□□ 15
PABPC4Q13310 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.984e-6■■■□□ 15
PABPC4Q13310 LRWD1-205ENST00000473880 5491 ntTSL 216.9■□□□□ 0.34e-6■■■□□ 15
PABPC4Q13310 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.582e-6■■■□□ 15
PABPC4Q13310 SPN-205ENST00000563039 1853 ntTSL 522.06■■□□□ 1.122e-6■■■□□ 15
PABPC4Q13310 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.071e-14■■■□□ 15
PABPC4Q13310 DDX3X-212ENST00000616050 818 ntTSL 513.84□□□□□ -0.191e-14■■■□□ 15
PABPC4Q13310 DDX3X-203ENST00000457138 5346 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.471e-14■■■□□ 15
PABPC4Q13310 DDX3X-215ENST00000625837 3237 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.511e-14■■■□□ 15
PABPC4Q13310 DDX3X-216ENST00000626301 3013 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.581e-14■■■□□ 15
PABPC4Q13310 DDX3X-217ENST00000629496 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.61e-14■■■□□ 15
PABPC4Q13310 DDX3X-218ENST00000629785 3457 ntTSL 510.96□□□□□ -0.661e-14■■■□□ 15
PABPC4Q13310 DDX3X-220ENST00000630370 3120 ntTSL 510.86□□□□□ -0.671e-14■■■□□ 15
PABPC4Q13310 DDX3X-219ENST00000630255 3289 ntTSL 510.63□□□□□ -0.711e-14■■■□□ 15
PABPC4Q13310 DDX3X-221ENST00000630858 3181 ntTSL 510.54□□□□□ -0.721e-14■■■□□ 15
PABPC4Q13310 DDX3X-204ENST00000478993 3397 ntTSL 1 (best)10.16□□□□□ -0.781e-14■■■□□ 15
PABPC4Q13310 PLOD1-201ENST00000196061 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.298e-7■■■□□ 15
PABPC4Q13310 PLOD1-209ENST00000491536 639 ntTSL 311.62□□□□□ -0.558e-7■■■□□ 15
PABPC4Q13310 PLOD1-207ENST00000481933 2339 ntTSL 211.39□□□□□ -0.598e-7■■■□□ 15
PABPC4Q13310 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.453e-9■■■□□ 15
PABPC4Q13310 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.163e-9■■■□□ 15
PABPC4Q13310 TSN-202ENST00000409193 1436 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.157e-14■■■□□ 15
PABPC4Q13310 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.572e-16■■■□□ 15
PABPC4Q13310 TUG1-209ENST00000602971 1599 ntTSL 24.5□□□□□ -1.692e-16■■■□□ 15
PABPC4Q13310 SLC27A5-205ENST00000595851 2003 ntTSL 220.09■□□□□ 0.814e-7■■■□□ 15
PABPC4Q13310 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.744e-7■■■□□ 15
PABPC4Q13310 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.524e-7■■■□□ 15
PABPC4Q13310 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.274e-7■■■□□ 15
PABPC4Q13310 SLC27A5-206ENST00000599700 474 ntTSL 214.03□□□□□ -0.164e-7■■■□□ 15
PABPC4Q13310 SLC27A5-208ENST00000601997 575 ntTSL 213.22□□□□□ -0.294e-7■■■□□ 15
PABPC4Q13310 PTCD3-201ENST00000254630 6734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.861e-6■■■□□ 15
PABPC4Q13310 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.232e-10■■■□□ 15
PABPC4Q13310 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.992e-10■■■□□ 15
PABPC4Q13310 OAZ1-207ENST00000590943 1012 ntTSL 219.06■□□□□ 0.642e-10■■■□□ 15
PABPC4Q13310 GANAB-208ENST00000528503 608 ntTSL 212.62□□□□□ -0.391e-23■■■□□ 15
PABPC4Q13310 POLD1-206ENST00000596221 412 ntTSL 220.06■□□□□ 0.83e-7■■■□□ 15
PABPC4Q13310 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.818e-37■■■□□ 15
PABPC4Q13310 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.028e-37■■■□□ 15
PABPC4Q13310 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.518e-37■■■□□ 15
PABPC4Q13310 RPL8-208ENST00000529163 556 ntTSL 213.86□□□□□ -0.198e-37■■■□□ 15
PABPC4Q13310 NAA10-211ENST00000477750 1062 ntTSL 224.24■■□□□ 1.472e-8■■■□□ 15
PABPC4Q13310 NAA10-204ENST00000393710 525 ntTSL 218.9■□□□□ 0.622e-8■■■□□ 15
PABPC4Q13310 MAPK1-201ENST00000215832 11022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.618e-11■■■□□ 15
PABPC4Q13310 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.519e-7■■■□□ 15
PABPC4Q13310 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.339e-7■■■□□ 15
PABPC4Q13310 RPS27-202ENST00000392558 625 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.85e-31■■■□□ 15
PABPC4Q13310 OAZ1-206ENST00000589739 657 ntTSL 220.92■□□□□ 0.943e-10■■■□□ 15
PABPC4Q13310 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.754e-7■■■□□ 15
PABPC4Q13310 EMP3-202ENST00000593437 502 ntTSL 512.65□□□□□ -0.382e-15■■■□□ 15
PABPC4Q13310 EMP3-206ENST00000597279 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.432e-15■■■□□ 15
PABPC4Q13310 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.275e-11■■■□□ 15
PABPC4Q13310 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.695e-11■■■□□ 15
PABPC4Q13310 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.635e-11■■■□□ 15
PABPC4Q13310 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.565e-11■■■□□ 15
PABPC4Q13310 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.225e-11■■■□□ 15
PABPC4Q13310 WBP2-216ENST00000591831 1406 ntTSL 515.47■□□□□ 0.075e-11■■■□□ 15
PABPC4Q13310 WBP2-207ENST00000587642 3718 ntTSL 210.15□□□□□ -0.795e-11■■■□□ 15
PABPC4Q13310 DUT-206ENST00000558978 1171 ntTSL 321.95■■□□□ 1.11e-15■■■□□ 15
PABPC4Q13310 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.191e-15■■■□□ 15
PABPC4Q13310 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.081e-9■■■□□ 15
PABPC4Q13310 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.271e-8■■■□□ 15
PABPC4Q13310 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.146e-24■■■□□ 15
PABPC4Q13310 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.956e-24■■■□□ 15
PABPC4Q13310 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.741e-8■■■□□ 15
PABPC4Q13310 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.621e-8■■■□□ 15
PABPC4Q13310 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.231e-8■■■□□ 15
PABPC4Q13310 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.091e-8■■■□□ 15
PABPC4Q13310 PMF1-BGLAP-201ENST00000320139 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.071e-8■■■□□ 15
PABPC4Q13310 FAM53C-201ENST00000239906 4377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.465e-6■■■□□ 15
PABPC4Q13310 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.068e-9■■■□□ 15
PABPC4Q13310 FLNA-217ENST00000498411 368 ntTSL 317.34■□□□□ 0.378e-9■■■□□ 15
PABPC4Q13310 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.028e-9■■■□□ 15
PABPC4Q13310 FLNA-206ENST00000420627 8225 ntTSL 514.35□□□□□ -0.118e-9■■■□□ 15
PABPC4Q13310 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.28e-9■■■□□ 15
PABPC4Q13310 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.38e-9■■■□□ 15
PABPC4Q13310 FLNA-219ENST00000610817 7595 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.338e-9■■■□□ 15
PABPC4Q13310 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.962e-9■■■□□ 15
PABPC4Q13310 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.942e-9■■■□□ 15
PABPC4Q13310 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.812e-9■■■□□ 15
PABPC4Q13310 MED16-215ENST00000621073 492 ntTSL 518.45■□□□□ 0.542e-9■■■□□ 15
PABPC4Q13310 MED16-212ENST00000607471 2004 ntTSL 1 (best)17.36■□□□□ 0.372e-9■■■□□ 15
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