Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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