Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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IFT88Q13099 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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IFT88Q13099 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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IFT88Q13099 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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