Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
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GPS1Q13098 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
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GPS1Q13098 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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GPS1Q13098 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
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GPS1Q13098 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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