Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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