Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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