Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms