Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ABCC8Q09428 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC8Q09428 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms