Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms