Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms