Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms