Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RPS29P62273 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms