Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCE1P61221 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms