Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB25P57735 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB25P57735 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB25P57735 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB25P57735 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB25P57735 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB25P57735 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB25P57735 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB25P57735 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB25P57735 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB25P57735 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB25P57735 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB25P57735 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB25P57735 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB25P57735 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB25P57735 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB25P57735 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB25P57735 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB25P57735 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB25P57735 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB25P57735 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB25P57735 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB25P57735 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB25P57735 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB25P57735 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB25P57735 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB25P57735 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms