Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRG3P56975 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRG3P56975 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRG3P56975 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRG3P56975 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRG3P56975 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRG3P56975 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRG3P56975 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRG3P56975 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRG3P56975 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRG3P56975 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRG3P56975 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRG3P56975 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRG3P56975 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRG3P56975 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRG3P56975 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NRG3P56975 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NRG3P56975 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRG3P56975 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRG3P56975 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms