Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCR4P51679 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCR4P51679 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCR4P51679 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCR4P51679 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCR4P51679 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCR4P51679 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCR4P51679 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCR4P51679 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCR4P51679 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCR4P51679 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCR4P51679 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCR4P51679 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCR4P51679 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCR4P51679 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCR4P51679 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCR4P51679 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCR4P51679 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCR4P51679 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCR4P51679 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCR4P51679 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCR4P51679 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCR4P51679 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCR4P51679 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCR4P51679 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCR4P51679 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCR4P51679 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCR4P51679 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCR4P51679 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCR4P51679 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms