Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZEB1P37275 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms