Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms