Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms