Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms