Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms